Первыми на Амуре под удар стихии попал Благовещенск и Еврейская автономная область. В ЕАО произошел размыв дамбы у села Ленинское. Уровень воды в Амуре поднялся до 930 см, превысив критическую отметку на 80 см. Восстановлением дамбы занимались более 300 человек военных, спасателей и добровольцев.
В середине сентября большая вода зашла в населенные пункты Хабаровского края. Из-за прошедших сильных дождей поднялся уровень воды в реках и уровень грунтовых вод. Под удар стихии попали 33 населенных пункта. К 20 сентября подтопленными оказались 30 жилых домов, 2282 земельных, приусадебных и дачных участка, 41 участок дорог. В Нанайском районе вода подошла к федеральной трассе. Окруженные водой люди оказались без питьевой воды. Спасатели доставляли питьевую воду, помогали вытаскивать из воды автомобили, перевозили людей через затопленные участки дорог. На набережной в Хабаровске спешно пришлось разворачивать и укреплять водоналивную дамбу. Ливни потоком воды сместили несколько пролетов конструкции. К работам привлекли волонтеров, которые наполняли мешки песком и щебнем. Агитировать никого не пришлось, молодежь моментально откликнулась на призыв.
Самая сложная обстановка сложилась тогда в селе Корсаково-2. На базе санатория «Уссури» был открыт пункт временного размещения, однако жители поселка предпочли переждать наводнение у родных и знакомых. Поймы рек Амгунь, Бурея, Кур, Уссури, Тунгуска были затоплены на 0,1 – 1,9 м. На Амуре пойма у села Елабуга была затоплена на глубину до 3,2 м. А вода в Амуре возле Хабаровска поднималась ежедневно на 10 – 40 см. 25 сентября уровень воды достиг 700 см, что выше критической отметки на 100 см. Островные места Хабаровска были подтоплены. Дежурные спасатели вывозили дачников.
После 20 сентября уровень воды в Амуре близ Хабаровска перестал подниматься, на пути воды был Комсомольск-на-Амуре. Городу еще в августе было выделено 15 миллионов рублей для борьбы с паводком. Тогда все дамбы были подняты до уровня в девять метров. 25 сентября уровень воды там превысил отметку опасных явлений. За сутки прибыло 18 см. Подтопленными оказались участки садоводческого товарищества «Ветеран-1». Поднявшиеся грунтовые воды подтопили подвалы 4 детских садов, Дворца творчества детей и молодёжи, Драматического театра, а также подвалы 45 многоквартирных домов. Были спешно доставлены 100 тысяч мешков, которые заполняли песком волонтеры, коммунальщики. Было завезено 948 м3 грунта. Укреплялись шиберы печально известной с 2013 года Мылкинской дамбы и дамбе на ул.
Дзержинского, для чего были доставлены 350 м3 грунта. На самых сложных местах были установлены 40 насосов. После 25 сентября гребень паводка покинул Комсомольск, но обстановка в городе продолжает оставаться сложной. Дело в том, что грунтовые воды залегают под городом на глубине от нуля до 2,8 метра. Минимум отмечается в марте, максимум – в сентябре. Наводнение и осадки утопили город. И хотя уровень воды в Амуре сейчас снижается ежедневно на 5-10 см, обстановка в городе не улучшается.