Новий метод для оцінки генетичної варіабельності пухлинних клітин дозволить онкологів виявляти пацієнтів з найбільш агресивних раком і прогнозувати відповідь на терапію.

Унікальна технологія була представлена ??дослідниками Всестороннього онкологічного центру Університету штату Огайо, Онкологічної лікарні Артура Джеймса і Дослідницького інституту Річарда Солова (OSUCCC - James).

Вчені назвали свій метод оцінки MATH (mutant-allele tumor heterogeneity).

Для його розробки вони використовували дані генетичного аналізу ракових клітин, взятих у 305 пацієнтів з пухлинами голови і шиї з Атласу генома раку (TCGA). Висока оцінка за шкалою MATH відповідає наявності великої кількості різних мутацій в клітинах.

Дослідники говорять, що наявність клітин з різними генетичними мутаціями в одній пухлини (внутрішньопухлинно гетерогенність) асоціюється з низькою виживання хворих. Якщо проспективні дослідження підтвердять надійність методу MATH, то його можна буде використовувати для добору найбільш ефективного лікування і прогнозування.

«Довгий час вчені вважали, що наявність безлічі субпопуляцій ракових клітин в межах однієї пухлини пов'язане з гіршими клінічними результатами. Проте, онкологи сьогодні ніяк не використовують внутрішньопухлинно гетерогенність для прийняття клінічних рішень і прогнозу, тому що до сих пір не існує точного і досить простого способу зробити це в умовах лікарні », - пишуть автори нового методу.

Щоб вирішити цю проблему, доктор Джеймс Рокко (James Rocco) і його колеги розробили шкалу MATH, яка істотно спрощує оцінку генетичної варіабельності ракових клітин і надає їй цілком конкретний практичний сенс.

Результати їх роботи були опубліковані днями в онлайн-журналі PLOS Medicine. У своїй статті вчені розповіли, як їм вдалося підтвердити зв'язок між високою генетичною варіабельністю клітин плоскоклітинного раку і смертністю.

«Генетична варіабельність всередині пухлини зазвичай пояснює, чому пацієнти не відповідають на терапію. У хворих з високо гетерогенними пухлинами є клітини з різними мутаціями, які обумовлюють стійкість раку до тієї чи іншої терапії », - пояснює Рокко, професор онкології, завідувач відділенням хірургії голови та шиї OSUCCC - James.

Для розробки MATH використовувалися дані з атласу TCGA, який є проектом Національного інституту здоров'я США. Цей проект, в рамках якого вчені збирають зразки пухлин з усієї країни, був запущений в 2006 році. Сьогодні в атласі є більше 11 000 зразків 33 типів пухлин.

Дослідники проводили генетичне секвенування кожного зразка плоскоклітинного раку голови і шиї, потім систематизували всі виявлені мутації клітин. Вони підтвердили, що з ростом внутрішньопухлинно гетерогенності збільшується смертність. Кожні 10% суми балів за шкалою MATH відповідали збільшення смертності хворих в середньому на 8,8%. Вчені взяли до уваги наявність папіломавірусу і важливі молекулярні характеристики пухлин.

«Наш аналіз показав, що пацієнти з високою гетерогенністю пухлин помирають вдвічі частіше порівняно з групою, у якій клітини пухлин відносно однорідні. Ця інформація може істотно вплинути на прогнозування і прийняття рішень », - каже професор.

medbe. ru.

Ключові слова:.