Его похоронили в Киево-Печерской лавре около колокольни храма Рождества Богородицы. Заупокойную по умершему провел митрополит Черновицкий и Буковинский Онуфрий, который замещал Владимира, пока он находился в больнице.

На церемонии отпевание присутствовали митрополиты из Канады, Германии, Польши, Испании, Молдовы и Крыма. Однако, предстоятель православной церкви, Московский патриарх Кирилл не приехал на похорон. Он прислал вместо себя митрополита Волоколамского Илариона. В России официально пояснили такое решение опасностью "выступления радикалов". Напомним, митрополит Владимир умер утром 5 июля на 79 году жизни. 26 июня состояние здоровья митрополита ухудшилось, у него открылось кровотечение.