Миллеру было 90 лет, последние годы он провел в пансионе для пожилых людей в пригороде Праги. Смерть мультипликатора подтвердили сотрудники санатория.
О смерти Миллера стало известно, когда внучка мультипликатора Каролина объявила о создании Фонда Зденека Миллера. Целью фонда будет обучение детей, в том числе с помощью «интересных альтернативных методов».
Первый мультфильм с Кротом был снят в 1957 году и получил «Золотого льва» на Венецианском кинофестивале.